Fakultas Psikologi berawal dari jurusan Psikologi Pendidikan dan Bimbingan (PPB) sebagai bagian dari Fakultas Ilmu Pendidikan (FIP). Fakultas Psikologi Universitas Muhammadiyah Purwokerto akhirnya berdiri sendiri pada tanggal 08 April 1998 berdasarkan SK Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia No. 133/DIKTI/Kep/1998.  

Pada tahun 2016, berdasarkan Keputusan Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi Nomor: 1379/SK/BAN-PT/Akred/V/2016, Fakultas Psikologi Universitas Muhammadiyah Purwokerto, terakreditasi dengan peringkat B